No se han descrito efectos secundarios sistémicos provocados por el ozono, los efectos secundarios detectados normalmente han sido derivados de la técnica de transfusión. En 1982 un estudio alemán con 384,775 pacientes a los que se le aplicaron 5.779.238 tratamientos con ozono se observo solo un 0,0007% de efectos adversos.

Contraindicaciones:

• Hipertiroidismo
• Deficiencia de glucosa-6-fosfato deshidrogenasa (favismo)
• Intolerancia al ozono

Efectos secundarios

• Trastornos circulatorios, como vértigo, sofocos, etc.
• Reacciones alérgicas, (generalmente suelen ser provocadas por medicamentos coadyuvantes o anticoagulantes utilizados).